Istituita con la legge regionale 26 Marzo 2003, n. 9, ai sensi dell'art.27 della legge regionale  16 luglio 1998, n. 30 (Disposizioni in materia di trasporto pubblico locale), l'Aremol è un ente strumentale della Regione dotato di personalità giuridica, di autonomia statutaria, amministrativa, regolamentare, organizzativa, finanziaria e contabile.

Esercita le proprie attività conformandosi agli indirizzi politico-programmatici approvati dal Consiglio Regionale ed alle direttive della Giunta Regionale e nel rispetto delle indicazioni funzionali della Direzione Regionale Trasporti.